Van der Sloot stond terecht, omdat hij grote ladingen cocaïne de gevangenis van Juliaca liet binnensmokkelen. De drugs werden meestal in suikerbieten verstopt en via een familielid van een medegevangene de gevangenis binnengebracht.

De Nederlander speelde volgens de rechtbank een belangrijke rol in de smokkel. Van der Sloot verkocht de drugs niet alleen aan medegevangenen, maar verstopte de cocaïne ook in postpakketten die hij naar adressen in het buitenland verstuurde. Zo had hij een winstgevende drugshandel, totdat bewakers de smokkel ontdekten.

Van der Sloot zit al vast voor de moord op Flores. In 2012 is hij in Peru veroordeeld tot 28 jaar gevangenisstraf. Ook wordt hij verdacht van betrokkenheid bij de verdwijning van de Amerikaanse Natalee Holloway in 2005. Na hun ontmoeting is nooit meer iets van Holloway vernomen.

De 18 jaar cel voor drugssmokkel komt boven op de 28 jaar die Van der Sloot al aan het uitzitten was. In de praktijk moet hij 7 jaar langer vastzitten, doordat celstraffen in Peru niet boven de 35 jaar mogen uitkomen. Van der Sloot komt daardoor in 2045 vrij.